Народний депутат від «Слуги народу» Гео Лерос передав до НАБУ документи, які, за його твердженням, містилися на комп'ютері колишнього депутата Київради Дениса Комарницького. За даними Лероса, матеріали свідчать про можливу корупційну діяльність голови Офісу Президента Андрія Єрмака, нардепа Миколи Тищенка та Комарницького.
З 2016 по 2017 рік компанія «Еко-Буд-Трейд» отримала від КП «Дирекція будівництва дорожньо-транспортних споруд Києва» кілька підрядів на будівництво частини Подільсько-Воскресенського моста загальною вартістю понад 6 мільярдів гривень. За даними аналітичної платформи YouControl, першозасновником компанії був Дмитро Кириченко із села Росава на Київщині. Нинішній співвласник Максим Половко через ланцюжок партнерів пов'язаний із компаніями, близькими до директора КП «Житлоінвестбуд-УКБ» В'ячеслава Непопа.
Директором «Еко-Буд-Трейду» із березня 2016 року був Сергій Васильович Драч, колишній перший заступник голови Державної архітектурно-будівельної інспекції України та голова наглядової ради «Київміськбуду». Неформальним власником будівельної компанії називають Комарницького. До управління підприємством мають відношення сестра нардепа Тищенка Юлія та її чоловік Герман Блінов.
Тендери на роботи проводили у «Віснику держзакупівель», тому договори та кошториси не були оприлюднені. Це унеможливило порівняння цін матеріалів та обладнання з ринковими цінами на предмет можливого завищення. Субпідрядники переможця залишилися невідомими.
З документів, оприлюднених Леросом, випливає, що у 2018 році Комарницький ймовірно мав намір передати «Еко-Буд-Трейд» чинному нардепу від ОПЗЖ Вадиму Столару та забудовнику Максиму Микитасю. Натомість вони мали сприяти тому, щоб інші фірми з орбіти Комарницького продовжили вигравати столичні тендери.
На матеріалах, які передав Лерос, міститься перелік із 38 компаній, які через підставних осіб ймовірно контролює Комарницький. Протягом останніх чотирьох років ці фірми здобули на ініційованих київськими комунальниками тендерах підряди на майже 13 мільярдів гривень. Серед них – «Скайбуд Груп», «Варда Спецбуд Монтаж» та «БК Роял Хаус».
31 жовтня 2019 року слідчі СБУ провели обшук в офісі Комарницького, розташованому в Музейному провулку, 2-Б. Силовикам довелося зламувати двері. У приміщенні виявили сліди поспішного знищення документів.
Комарницький фігурує у низці корупційних скандалів. У 2010 році він разом з В'ячеславом Супруненком, Денисом Бассом, Анатолієм Чубом і Олесем Довгим організував рейдерське захоплення книгарні «Сяйво». За твердженням очевидців, вони перебували у стані алкогольного сп'яніння. Працівників магазину побили і викинули на вулицю, фотокореспонденту зламали камеру і пальці. 8 квітня 2011 року працівники СБУ затримали Комарницького у приміщенні Київської мерії. У грудні 2012 року Шевченківський райсуд Києва засудив його до двох років умовно.
За словами голови слідчої комісії Кирила Куликова, «Комарницький був одним з керівників цієї злочинної організації. Він займався тим, що розподіляв між депутатами фракції – за конкретні голосування – комусь землю, комусь гроші, комусь ще щось».
У ЗМІ ім'я Комарницького пов'язують із нелегальним сигаретним транзитом з ОРДЛО до Західної Європи та «кришуванням» тютюнового бізнесу, який тривалий час був сферою інтересів Андрія Холодова, кума дружини Віктора Медведчука Оксани Марченко.
У 2019 році Комарницький разом з Аллою Шлапак, яка володіє базою даних «бабусь Черновецького», стали керівниками виборчого штабу Миколи Тищенка, обраного за 219 мажоритарним округом у Святошинському районі столиці. У березні 2020 року через Telegram-канал «Темний лицар» стало відомо, що список «Слуги народу» для виборів Київради формується Степаном Черновецьким і Віталієм Кличком, а сполучною ланкою нібито виступає Комарницький.
Сестра Миколи Тищенка Юлія є кінцевим бенефіціаром фірми «Експрес-К», яку також пов'язують із Комарницьким. Компанія неодноразово вигравала державні тендери і заробила на цьому понад 12 мільйонів гривень. Герман Блінов, чоловік Юлії та бізнес-партнер Комарницького, фігурує у так званих «плівках Єрмака» у зв'язку з корупційними забудовами столиці, включаючи продовження окружної дороги вулиці Рокосовського та Шулявську розв'язку.
Родину Тищенка і Комарницького також пов'язує ресторан «Коін», розташований у бізнес-центрі, основним власником якого є Степан Черновецький. 23 квітня цього року журналісти помітили Mercedes Комарницького, припаркований біля ресторану «Купецький двір» у Конча-Заспі поруч із автомобілем Вадима Столара. Цей заклад, як і тищенківський «Велюр», продовжував обслуговувати VIP-відвідувачів попри карантин.