Іван Бавикін, який нещодавно став керівником ДП «Державний експертний центр МОЗ України», раніше був фігурантом двох спроб порушення кримінальних справ. Про це свідчать записи в реєстрі судових рішень, які стосуються його роботи на посаді директора ДП «Укртрансфармація» у 2007–2008 роках.
У червні 2009 року заступник Київського транспортного прокурора порушив кримінальну справу проти директора ДП «Укртрансфармація» за зловживання службовим становищем та службовим підробленням. Бавикіна звинувачували в тому, що у 2008 році він передав у користування ТОВ «Абрил Формулейшнз» приміщення державної власності за заниженою вартістю. Йшлося про приміщення ДП «Укртрансфармація» площею 273 кв.м на першому поверсі будівлі по вул. Ташкентська, 60 у Києві. Замість договору оренди сторони підписали договір зберігання, не перерахувавши 70% орендної плати до загального фонду державного бюджету. Збитки державним інтересам оцінювалися майже в 40 тис грн. Однак у жовтні 2009 року постанова прокурора про порушення кримінальної справи була скасована судом за скаргою директора ДП «Укртрансфармація».
Суд врахував, що в матеріалах прокуратури, на підставі яких було порушено справу, відсутні дані про завдання збитків чи ненадходження коштів до державного бюджету. Також не було даних про те, що договір між «Укртрансфармацією» та «Абрил Формулейшнз» раніше визнавався судом недійсним чи фіктивним.
У 2011 році кримінальну справу проти ДП «Укртрансфармація» намагалося ініціювати ТОВ «ВВС-лтд». У 2007–2008 роках фірма поставила держпідприємству медикаменти на суму 0,44 млн грн. Термін виплати минув, але замовник не розрахувався. Постачальник розцінив це як шахрайство і вимагав порушити кримінальну справу за цією статтею. Правоохоронці відмовили у порушенні кримінальної справи, і фірма оскаржила цю відмову в суді. Однак суд виніс аналогічне рішення та вказав на те, що у грудні 2009 року Господарський суд Києва прийняв рішення про стягнення на користь «ВВС-лтд» суми 0,44 млн грн. Отже, суд не вбачив підстав для порушення кримінальної справи, оскільки справа щодо заборгованості ДП «Укртрансфармація» вже була вирішена Господарським судом Києва. Чи було виконане це рішення і чи отримала «ВВС-лтд» гроші, залишається невідомо.
Після «Укртрансфармації» Бавикін також очолював ДП «Український медичний центр сертифікації» (2008–2009) та Державну службу з лікарських засобів у Києві (2010–2011). Донедавна Іван Бавикін працював помічником народного депутата від Блоку Петра Порошенка Гліба Загорія, власника фармацевтичного заводу «Дарниця». За інформацією громадського руху «Чесно», Бавикін зник зі списку помічників Загорія саме напередодні призначення керівником Державного експертного центру МОЗ.
Державний експертний центр надає висновок щодо того, чи може той чи інший препарат продаватися на території України. Після цього Державна служба з лікарських засобів видає дозвіл на реєстрацію препарату в Україні. У зв'язку з цим організація «Центр протидії корупції» та благодійний фонд «Пацієнти України» заявили про конфлікт інтересів у призначенні Бавикіна керівником Державного експертного центру. Активісти припускають, що через Бавикіна «Дарниця» може отримати доступ до інформації щодо інноваційних препаратів та їх випробовувань або скористатися можливістю не допустити на ринок продукти конкурентів, як це колись було з литовським препаратом «Мілдронат».